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Comparaison de bases de molécules (chimiothèque)

Les laboratoires de chimie enrichissent constamment leur base de molécules au fur et à mesure des synthèses nouvelles réalisées.


L’utilisateur veut pouvoir comparer sa base de molécules à celles qui existent dans emolgine.

Il importe sa base dans emolgine sous forme de smiles (ou autre format).

emolgine vérifie la standardisation des molécules, calcule le inchikey ainsi que le fingerprint s’il nexiste pas dans le fichier Vfp.hdf5. Les molécules sont ensuite regroupée en Cluster_mol_db grâce à la méthode du minhash. Les rélations de similarité entre ces Cluster_mol_db sont évaluées et intégrées dans emolgine. Grâce au minhash, la comparaison entre la base de l’utilisateur et une autre base peut se faire rapidement. Le résumé peut être donné sous forme d’un graphe.