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Emolgine™ Version 0.5-3
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Essai Creation Molecule
Exploration Cluster
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Etude du ligand EMPA et des récepteurs de l’orexine.
Analyse de l’entrée de la sérodoline dans le récepteur 5HT2a
Validation de pathDock
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Exemples simples
Rercherche par attribut partiel
Recherche de cluster_mol_sites avec au moins n molécules
Recherche des molécules reliées à un cluster_mol_db
Recherche de molécules pouvant potentiellement se fixer à au moins n sites différents
Recherche des cluster_mol_site voisins d’un cluster_mol_site
Recherche des Clusters_mol_site associés à un Site qui sont liés à la base de données Ambinter
Méthodes utilisées dans Emolgine
Génération de molécules spécifiques à un site
Similarité utilisée entre les clusters de molécules.
Use-cases
Recherche des molécules similaires à une molécule donnée
Recherche de molécules à partir d’un fragment dans un site
Recherche de molécules compatibles avec un site et incompatibles avec d’autres sites
Comparaison de bases de molécules
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Intégration des modules externes
Modèle DNN du logP de Nadin Ulrich
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